Instytut Technologii Fermentacji i Mikrobiologii współpracuje z zagranicznymi jednostkami naukowymi:
- National University of La Plata, Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas (INIFTA), Departamento de Química, Facultad de Ciencias Exactas, Argentyna
- Universidad de Zaragoza, Instituto de Nanociencia y Materiales de Aragón (INMA), Consejo Superior de Investigaciones Científicas, Hiszpania
- Universidad de Buenos Aires, Laboratorio de Arqueometría, Instituto de Arqueología (ArqueoLab-IA), Argentyna
- School of Biological Sciences & Biotechnology, Beijing Forestry University, Department of Food Science, Chiny
- Council of National Research of Italy (CNR), Institute for Biological Systems, Włochy
- Consiglio per la ricerca in agricoltura e l'analisi dell'economia agraria (CREA), Centro di ricerca Agricoltura e Ambiente (CREA-AA), Włochy
- University of Verona, Department of Biotechnology, Włochy
- Franklin W. Olin College of Engineering, Stany Zjednoczone